使用Prism 7分析、图解、展示科学数据,体验前所未有的神速
概述
GraphPad Prism可用于Windows和Mac计算机,结合了科学绘图、综合曲线拟合(非线性回归),让您可理解的统计和数据组织。
GraphPad Prism最初是为医学院校和药物公司的实验生物学家设计的,特别是在药理学和生理学方面。如今,各种生物学家以及社会和物理学家已广泛使用Prism。超过110个国家的20多万科学家依靠Prism来分析、图解和展示科学数据。本科生和研究生广泛使用Prism。
非线性回归:
非线性回归是分析数据的重要工具,但通常比它需要的更困难。没有其他程序能把曲线拟合简化得和Prism一样。事实上,您通常可以在一个步骤中拟合曲线。只需从广泛使用的方程式列表中选择一个方程式(或输入您自己的方程式),Prism将自动适应该曲线,将结果显示为表格,在图表上绘制曲线,并插入未知值。
将多个数据集的数据并排放在一个有组织的数据表上,Prism可以一次性适应所有数据集。您可以将相同的模型分别应用到每个数据集,使用全局非线性回归在数据集之间共享参数值,或者将不同的模型适用于不同的数据集。
Prism还为您提供了许多高级配件选项。它可以将最佳拟合参数的置信区间报告为不对称范围(轮廓似然法),其比通常的对称间隔准确得多。它还可以自动内插来自标准曲线的未知值(即分析RIA数据),使用F测试或Akaike的信息准则(AIC)比较两个方程的拟合、图残差、识别异常值、差分重量数据点、正态性的测试残差,等等。
可理解的统计
虽然它不会取代重型统计程序,Prism允许您轻松地执行实验室和临床研究人员通常使用的基本统计测试。Prism提供t检验、非参数比较、一,二和三因素方差分析、应急表分析和生存分析。分析选择以清晰的语言表示,避免不必要的统计术语。
与其他程序不同,Prism在需要时提供易于理解的统计帮助。任何数据分析对话框均可点“Learn”,Prism的在线文档将为您解释分析的原理,这可帮助您做出适当的选择。一旦您做出选择,Prism就会在组织有序且易于跟踪的表格上呈现出结果。Prism文档囊括的内容超出了您的预期。其中一半以上用于彻底解释基本统计和非线性曲线拟合,教您如何正确分析数据所需的知识。
分析检查表
一旦您完成了分析,Prism的独特的分析检查清单帮助您确保选择的分析符合实验设计,并且确保您了解分析背后的假设。
回溯每个分析
除非您能够准确地记录数据如何分析,否则就不是真正的科学。在Prism这不是一个问题。您永远不会想知道结果是如何实现的。即使工作是由其他人完成的,您也可以查看(和更改)所有分析选择,并查看分析的顺序(即在曲线拟合之前X值被转换为对数)。同样,您可以轻松检查误差棒是否代表SD或SEM(或其他)。
自动化,无需编程
Prism项目的所有部分都已链接。这意味着,当您修复数据输入错误时,Prism自动更新所有结果、图形和布局。另一个优点是,您可以立即分析重复实验。在您使用一个实验的数据完成分析和绘图步骤后,您不必重复所有这些步骤。Prism提供了几种方法来回收您的工作 - 即时分析和绘制重复实验,而不需要重复任何冗长的步骤,也不需要任何脚本或编程。 Prism还为那些想要更复杂自动化的人提供了一种脚本语言。
自动错误条
如果输入原始数据,Prism可以自动将误差条绘制为SD、SEM、范围、四分位数范围或95%置信区间。
如果您在其他地方计算错误值,请将其输入到带标签(SD或SEM)子列中。Prism的分析(即t检验、ANOVA、回归)将考虑SD(或SEM)和样本大小。
工作的完整记录
Prism项目文件可以包含多个数据、分析和图形。Prism文件可以是您的实验的完整记录。每个文件可以包含任意数量的数据表、信息页、分析结果、图形和页面布局。
数据表不仅可以包含您分析的数据和图形,还可以包含您决定排除的数据,这些数据仍保留在数据表中(以蓝色斜体显示)。您可以将以后会查看的值突出显示。
每个信息页可以存储非结构化注释和结构化信息常量,例如批号、集中度、笔记本页码等。
图形和布局可以用文本、线条、箭头、框、表、方程、图片等进行装饰。
使用带有颜色标记的浮动注释注释任何页面,并突出显示(以您选择的颜色)要再次查看的网页的名称,或希望其他人审核。
将Prism文件保存在计算机或网络上,或直接保存到LabArchives,一个基于云的实验室笔记本。
准备好发布
Prism将您从原始数据转换为可用于演示文稿、海报或出版物的图形(或布局)。单击即可将完成的图形或布局发送到PowerPoint或Word。 当然,也复制和粘贴工作。导出到TIFF、EPS、JPG、PDF(以及更多其他格式),以及满足科学期刊要求所需的所有选项。
Prism 7有哪些新功能?
Prism 7允许您进行更多种类的统计分析,制作更多种类的图形,并更灵活地组织数据。
以下是一些亮点:
热图
三向ANOVA
FDR方法进行多重比较
来自非线性回归的更准确(不对称,相似性)置信区间
子栏标签
工作薄名称的彩色编码,以及表格的选中单元格
半透明的颜色,让您可以看到重叠
将日期(或已用时间)输入为X值
统计比较
•配对或非配对t检验。报告P值和置信区间。
•非参数Mann-Whitney检验,包括中位数差异的置信区间。
•Kolmogorov-Smirnov检验比较两组。
•置信区间为中位数的Wilcoxon检验。
•使用错误发现率(或Bonferroni多重比较)同时执行许多t检验,以选择哪些比较是进一步研究的发现。
•普通或重复测量单因素方差分析,然后是Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni或Holm-Sidak多重比较检验,趋势后检验或Fisher最小显着性检验。
•许多多重比较测试伴随有置信区间和多重调整的P值。
•Greenhouse-Geisser校正,因此重复测量单因素方差分析不必假设球形。当选择这个时,多个比较测试也不假定球形。
•Kruskal-Wallis或Friedman非参数单因素方差分析与Dunn的后检验。
•Fisher精确检验或卡方检验。用置信区间计算相对危险度和优势比。
•双向方差分析,即使有一些后期测试的缺失值。
•双因素方差分析,在一个或两个因素中重复测量。Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferron、Holm-Sidak或Fishers LSD多重比较测试主要和简单的效果。
•三因素方差分析(限于两个因素中的两个水平,第三个水平中的任意数量水平)。
•Kaplan-Meier生存分析。将比较曲线与对数秩检验(包括趋势检验)。
列统计
•计算最小、最大、四分位数、平均值、SD、SEM、CI、CV,
•平均或几何平均值与置信区间。
•频率分布(bin到直方图),包括累积直方图。
•通过三种方法进行正常性测试。
•一个样品t检验或Wilcoxon检验,以将柱平均值(或中值)与理论值进行比较。
•偏度和峰度。
•使用Grubbs或ROUT方法识别异常值。
线性回归和相关
•以置信区间计算斜率和截距。
•强制回归线通过指定点。
•适合重复Y值或平均值Y.
•使用运行测试测试线性度的偏差。
•计算和图形残差。
•比较两条或更多回归线的斜率和截距。
•沿标准曲线插入新点。
•Pearson或Spearman(非参数)相关。
•使用Bonferroni多重比较或FDR方法分析一叠P值,以确定“重要”发现或发现。
非线性回归
•选择我们的105个内置方程式的任意一个或输入您自己的方程式。
•输入微分或隐式方程。
•为不同的数据集输入不同的方程。
•全局的非线性回归 - 共享数据集之间的参数。
•稳健的非线性回归。
•自动异常值识别或消除。
•使用额外的平方和F检验或AICc比较模型。
•比较数据集之间的参数。
•应用约束。
•通过几种方法对差异点进行加权、并评估加权方法的效果。
•采用自动初始估计值或输入您自己的值。
•在X值的指定范围内自动绘制曲线。
•量化参数的SE或CI拟合的精度。置信区间可以是对称的(如传统的)或不对称的(这是更准确的)。
•使用Hougaard的偏度来量化不精确性的对称性。
•绘制置信度或预测带。
•测试残差的正态性。
•运行或复制模型充分性的测试。
•报告协方差矩阵或依赖关系集。
•从最佳拟合曲线中轻松插入点。
临床(诊断)实验室统计
•Bland-Altman图。
•接收器操作特性(ROC)曲线。
•Deming回归(II型线性回归)。
模拟
•模拟XY,列或应急表。
•重复分析模拟数据作为蒙特卡罗分析。
•从您选择或输入的方程式和选择的参数值绘制函数。
其他计算
•带置信区间的曲线下面积。
•转换数据。
•规范化。
•识别异常值。
•正态性测试。
•转置表。
•减去基线(和组合列)。
•将每个值计算为其行,列或总计的一小部分。
系统要求
•用于Windows的Prism 7在32位或64位版本的Windows Vista,7,8或10下运行.Prism将运行在小到800 x 540的屏幕上。虽然在64位版本的Windows上运行良好,它是一个32位程序。
•Prism 7 for Macintosh需要OS X 10.9(Mavericks)或更高版本。
•Prism在硬盘驱动器上需要90兆字节的空间。
GraphPad Prism官网: http://www.graphpad-prism.cn/
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